我可能有些post里没有标注阅读的文章是哪一篇,想要查文章的时候,需要看博客的连接,连接的英文名字就是文章的title。

这篇文章是15年三月份发表在nature genetics上的。构建了一个癌症最初生长、发展的模型。

主要是说癌症相关的基因突变一开始就有,并且一开始就不止一个突变,每个不同的突变会形成一个subclone,从而不断生长。 有些突变生来就是坏突变,容易长成大的subclone,容易转移。这些特性从一开始就在癌症的subclone里存在了。

CNV和CNA概念以及其区别12

CNV(copy number variation)是生殖细胞的染色体区域/基因的拷贝数增加与减少。 CNA(copy number alteration)是体细胞的染色体区域/基因的拷贝数增加与减少。

简要介绍

文章还是可以的,但是有点读不进去。

主要是用CNA和一些病人特异性的私有mutation来判断是不是产生早的突变可扩散到很远的位置,由此来说明文章的观点Big Bang模型。

癌细胞的突变容易扩散,腺瘤突变基本有界,不容易扩散。

文章中的统计推断部分用到了他们之前发表的一篇文章的内容Single-molecule genomic data delineate patient-specific tumor profiles and cancer stem cell organization.

在比较毗连的细胞间差异性的时候用到了Shannon-Index

参考资料

单词本

英文 中文 英文 中文
primordial 原发 malignant 恶性
malignancy 恶性肿瘤 neoplasm 肿瘤
pervasive 无处不在 experimentally 实验证明
stepwise 逐步的 paradigm 范例
confer 商议、比较 recapitulate 摘要,总结
variegation 五花八门,彩斑 progeny 后代
propagate 繁衍 glandular 腺状的
phylogenies 系统发育 aberrant 畸变
colon crypt 结肠隐窝 obscure 掩盖
respective 各自、分别的 corroborate 证实
recapitulate 总结 chemotherapy 化疗