忙了一周,本打算把论文重现做到call SNPs这步,结果却是只完成到了序列的拼接,英语就看了1次单词,2篇短文,专业课的书籍完全还没开始动,这么悲催的进度实在不堪入目。每周写点博客,结果发现这周写的主题涉及学校,得等老师给我分数之后再放出来,现在老师们搜索的水平都很高,不想被人肉。

目前在博客的首页增加了新的一页,叫做记事,主要是记录一下自己每天突出理解或完成的工作。

今天还主动学习了一个新词花信年华

就这样,一周琐事,仅此而记之。


2月20日开学。在最后一个寒假里休息了9天之后,就滚回实验室了。

假期?再也没有什么假期了

记得在小学时,我幻想着初中还是会有时间思考天马行空创意无限的点子——结果彻底被初中的应试教育给毁了,变成榆木疙瘩

记得在初中时,我幻想着高中会有时间搞自己的副业(画画、做flash)——结果就记住高三时经常不写数学作业,大学直接杀进数学系

记得在高中时,我幻想着大学会有时间搞自己初中计划、高中想做却没做成的副业(画画、编写游戏(基于flash))——结果在SNC倒是没少用PhotoShop作图画画,做游戏早就抛到脑后了

记得在大学时,我幻想着能在边学好数学的同时多学一些生物的相关课程——结果差点连微积分都没学会,悲剧二战

回顾过去,我发现的确很少有时间能把自己的一些想做的事情付诸实践,这还是在有货真价实的假期时,现在连假期都没有了,稍稍觉得有些悲剧。

新学习展望:没有最苦,只有更累,调动一切可用体细胞,做好工作发好paper!


microRNA能在植物-动物间转移,它们能使目标基因序列沉默,抑制特定蛋白质合成。
食物掌控基因——《环球科学》2012.01期

赶在2月开始前,把组里一月份订的《环球科学》杂志看了个遍,这本杂志介绍的内容偏向科学领域的新进展,就是《科学美国人》中文版。有些文章很有意思,但是也有的文章翻译得不太理想,读不明白。比较有趣的是中国的科学家研究了 microRNA在植物-动物间转移的问题,说明植物的microRNA可以直接转移到人的体内。设想有这样一个情景:如果转基因植物A中的某个microRNA转移到了动物B的体内,这个microRNA恰能正常工作,会导致动物B体内的某些转录产物降解,而这个转录产物与疾病的发生又密切相关。外源的microRNA会在动物B体内产生了一系列的连锁反应,就有可能导致疾病的发生。

想到这个问题,就不得不谈到转基因动植物,如果转基因的动植物中有同类非转基因动植物中没有的microRNA,那么就有可能出现上段叙述的情况,看来转基因还是需要谨慎行事,我之前在书评:《DNA:生命的秘密》中认为转基因是没有任何问题的,这个想法指考虑到了DNA的层面,而没有考虑到现在发现的一些非编码小RNA的问题。在谈转基因动植物的时候,光考虑转基因所带来的microRNA是不行的,在非转基因的作物中有多少microRNA会转移到食物链的上层动物体内,也是需要研究的一个问题。总之这给我的提示是:要全面思考转基因的利弊,现阶段我们能做的事情还远远不够完全确定转基因的好坏。

那么在经过烹制的饭菜中含有的非编码小RNA(具体例如microRNA)是否能够直接进入我们人体?这个问题我尚未有准确的答案,不过supervisor给出了几种可能性:首先,我们知道在RNAi的实验过程中就做过让线虫直接吃含有microRNA的东西,可使microRNA进入线虫的细胞内。其次,烹制饭菜的过程是个加热过程,microRNA没有什么二级结构,所及加热应该不会使其变性。最后,在RNAi中microRNA会被一些蛋白“绑定”,蛋白质被加热后变性,就在microRNA外形成了一个保护层,确保在进入其他活细胞的时候,microRNA还具有活性。

因为还没查找具体的文献,现在就先写到这里,未完待续……


这是一篇迟到了3个多月的游记。

南海子公园位于北京城南中轴延长线,地处北京主城区、亦庄新城和未来大兴新城中间的核心地带,它的建设范围是:东起凉水河,西至104国道,北接南五环 路,南抵黄亦路,总体面积11.65平方公里,其中公园占地面积7.86平方公里。现在建成的一期工程位于公园的东南部,占地面积159.64公顷。

在金秋十月,班里几个同学一起去大兴南海子公园游玩,这个公园仍处在建设状态,一期工程的面积已经非常大了。估计一天下来走马观花,勉强能看完整个园区。由于时间有限(我领错路了orz)我们只去了其中的一部分。

先说一下乘车路线,五号线导亦庄线到旧宫,在坐953到鹿苑路。记住在亦庄线下车往西走是953总站,车比较少20分钟一辆,千万别往东走,Google地图也有坑爹的时候。到了鹿苑路下车要往南走在向东走,起码得有2km的距离,就到南面的小门了(就是露营进出门)。为啥这么远?因为南海子公园还在建设,一些侧门关闭了。16路汽车会到南海子公园南门前面的一条街,所以比较方便,我们回去时坐的就是它(有一站是地铁站)。

南海子公园风景优美,可以露营,以前是清朝皇家狩猎的地方,有麋鹿(四不像)苑,曾经是麋鹿的家乡(当然麋鹿在中国是地理灭绝了,从英国引进回来的)。

废话少说,上一些图。

麋鹿

麋鹿

鹿群

群鹿

湖边景色

湖边景色

花

南海子公园有音乐喷泉上午10点一次,下午2点一次。不过我们去时没有赶上完整的,只是在湖上的桥上随便看了一下。整个公园花卉品种非常多,有专门的花卉展区(应该是在喷泉那一侧,这次没有去)。bucter有一拨人早我们一天去,据说他们主要是占领了一块地方,搭帐篷做游戏,风景都没看。感觉园区里搭帐篷露营(不能生火)的人非常多,有些便利的地段都是帐篷。

比较有意思的还是看麋鹿(这可是第一次亲眼看见真的四不像!),看台距离麋鹿很遥远,麋鹿在树荫下悠闲的午休,旁边不时有几只黑天鹅经过,麋鹿栖息地的桥上刻着不同时期古人对麋鹿的描述,非常有意思。

最后合影一张

合影


马上就过完一波三折的2011年了,总体来说,今年是变化的一年。

首先,今年上半年从一名试用期员工,转变成了烟酒僧。从一名普通的数学专业学生变成了生命科学领域的科研“民工”。进入新的领域探索是一件非常有意思的事情,另外对于数学的知识有所加深,更加体会到它的重要性。 其次,跨专业也不是一件容易的事情,在大家考试都得90多分的时候,我只能得70、80分,真是惨。 再次,很多列出的计划都没有实现,英语没学好,专业课也有很多不会的东西,真是丢了数学也没弄好生物。

再列一下在明年上半年要完成的一些个人计划:

工作列表
翻译 GNU GSL
写爬虫分析bucter论坛
学习列表
Perl系列丛书:小骆驼、大骆驼、精通(未完待续)
统计建模与R软件(全部例题习题) 游戏列表
建立流感病毒变异模型,分析传播趋势

总体学习计划:学好专业课和英语,其他都是浮云。另外要争取提前毕业的机会。开阔视野,不再做文盲青年。面对一群有学识的文艺青年和普通青年,我这个文盲青年实在是差得太多了,赶紧把之前买的孔孟老庄国外文学都好好看一下,往草包里在添点墨水。

类似福尔摩斯,来列个目前我的知识范围

1、文学知识——无

2、哲学知识——无

3、天文知识——无

4、政治知识——浅薄

5、植物学知识——无

6、地质学知识——无

7、化学知识——无

8、解剖学知识——无

9、惊险案件知识——无

10、具有小学乐理知识、美术知识

11、体能基本为零

12、数学知识——半吊子水平

13、生物学知识——浅薄

14、计算机知识 ——100%的好人

2012年对我来说是奋斗的一年!

在此,祝愿所有的亲朋好友同学们在新的一年里都能心想事成!