NIPT(Noninvasive prenatal testing)非侵入式产前检测,国内一般称作“无创DNA产前检测技术”。之前一直没有时间看,这个技术究竟怎么从母亲的血液中测胎儿的DNA,现在有时间了,赶紧记录一下原理。

NIPT技术细分为两种:一种是测CNV,另一种是测SNP。 在2012年时比较流行的4中具体方式是1

  1. Sequenom 公司:定量,短序列全基因组测序,并且评估胚胎DNA含量
  2. Verinata 公司:定量,短序列全基因组深度测序,不评估胚胎的DNA含量
  3. Ariosa 公司:定量,目标区域扩增,并且根据SNP频率来确定胚胎DNA含量
  4. Natera 公司:基于非定量的SNP,分析等位基因频率(这个方法中用白细胞的测序结果作为母亲的基因型)

其中重点要说明的是,测CNV是不用区分母亲和胎儿的DNA的,首先,我们明确母亲没有任何一种三体综合征和染色体缺失,那么在这种条件下仍然检测出一定比例的三倍体或者单倍体,那么就说明是胚胎出现了问题。

从测序角度来说就是测序深度越高越精确,对于测序结果是否说明有染色体异常,用假设检验(Z-score)来估计其异常程度。

下图比较了四个公司的方法的准确性,可以看到对于21三体综合征是最准确的,对于18三体综合征和单倍体的检测准确性低。

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测不准的原因在于测序技术有GC偏好性,并且在13和X染色体上表现得很明显2

NIPT方法目前主要还是用于测染色体倍增或者缺失(截至2013年),对于一些微缺失和微倍增( microdeletions and microduplication )用芯片的方法也开展了检测研究。

我个人的理解,孕妇首先应该做常规血检和B超检查,如果检查认为有问题,可以先做一个无创DNA产前检测来确认一下,如果无创也指示有问题或者数值处于临界值,那么继续做羊水穿刺来确定。

我本认为技术应该很高超,结果看完相关网络资料发现不用区分母婴的DNA时,方法也就很常规了。