人类结肠癌生长的bigbang模型
我可能有些post里没有标注阅读的文章是哪一篇,想要查文章的时候,需要看博客的连接,连接的英文名字就是文章的title。
这篇文章是15年三月份发表在nature genetics上的。构建了一个癌症最初生长、发展的模型。
主要是说癌症相关的基因突变一开始就有,并且一开始就不止一个突变,每个不同的突变会形成一个subclone,从而不断生长。 有些突变生来就是坏突变,容易长成大的subclone,容易转移。这些特性从一开始就在癌症的subclone里存在了。
CNV和CNA概念以及其区别12
CNV(copy number variation)是生殖细胞的染色体区域/基因的拷贝数增加与减少。 CNA(copy number alteration)是体细胞的染色体区域/基因的拷贝数增加与减少。
简要介绍
文章还是可以的,但是有点读不进去。
主要是用CNA和一些病人特异性的私有mutation来判断是不是产生早的突变可扩散到很远的位置,由此来说明文章的观点Big Bang模型。
癌细胞的突变容易扩散,腺瘤突变基本有界,不容易扩散。
文章中的统计推断部分用到了他们之前发表的一篇文章的内容Single-molecule genomic data delineate patient-specific tumor profiles and cancer stem cell organization
.
在比较毗连的细胞间差异性的时候用到了Shannon-Index
。
参考资料
单词本
英文 | 中文 | 英文 | 中文 |
---|---|---|---|
primordial | 原发 | malignant | 恶性 |
malignancy | 恶性肿瘤 | neoplasm | 肿瘤 |
pervasive | 无处不在 | experimentally | 实验证明 |
stepwise | 逐步的 | paradigm | 范例 |
confer | 商议、比较 | recapitulate | 摘要,总结 |
variegation | 五花八门,彩斑 | progeny | 后代 |
propagate | 繁衍 | glandular | 腺状的 |
phylogenies | 系统发育 | aberrant | 畸变 |
colon crypt | 结肠隐窝 | obscure | 掩盖 |
respective | 各自、分别的 | corroborate | 证实 |
recapitulate | 总结 | chemotherapy | 化疗 |