从7月31日到现在,已经3个月没发过博客了,这三个月过得很快,进组后主要忙在工作上,也没有抽时间补写一些当时想写的内容。

停顿三个月的唯一好处是,有时间把博客从wordpress迁移到Jekyll(Github),告别了频繁的数据备份和wordpress升级。写博客从用RTF编辑器回归到直接用txt文档的模式,采用markdown语法,简单通用。

当然搬家不是一蹴而就的,这期间反复观察了n位前辈的Jekyll博客,对照自己之前的Wordpress博客把外观套了下来,没有系统学习,有点东拼西凑,有些功能例如“搜索”就没能保留下来(说白了就是我不会用JavaScript或Ruby写搜索)。大体框架还是没有变,这对我来说已经是挺好的一件事情了。

现在唯一遗憾的事情是,改域名DNS绑定之前,没有把wordpress的页面截图保存一份,以纪念我在Wordpress写博客的这一年多的时间。

之后呢,应该会补充几篇在这个时间点(10月30日)之前的文章,目前都处于草稿(在_posts文件夹中可见)或腹稿状态。

顺便记录一下,最近最喜欢的一句话:

Captains and Kings may rule the world, but it is the presence of those we love and the memory of those we have lost, but who continue to live in our hearts, which bring beauty to living and make all that we do worthwhile.
尽管还有队长或国王统治世界,但是那些现在身边的所爱的人,和对已经失去的但永存心中的人的回忆,带给世界美丽,并使我们做的一切都值得。(翻译是MOSQY提供的)


又是一篇迟到的游记,不过这次旅行基本没有玩成,遇到了中国特色的领导光临,想去哪哪都封路,副总理的确是个大官,他去玩,就封山关园,他去参观,博物馆就封闭,仅仅三天时间,都和他撞车,此行实在是不爽。

不过还是可以总结一下旅行指南,在旅行前,我们做的工作还是非常充分的。

伊春旅行指南

个人准备

必带物品

1.证件类:身份证,月票卡,借记卡

2.用品类:现金,钥匙,手表,眼镜,剪刀,小刀,卫生用品,水壶,雨伞,记事本,笔,毛巾

3.药品类:黄连素,感冒药,风油精,创可贴,藿香正气,消炎药,抗过敏类,肠胃类,驱蚊剂,防晒霜

4.衣裤类:长衣、长裤(注意防潮和耐脏)

5.数码类:手机,相机,存储卡,充电器,电池,手电筒,MP3

6.一次性用品:报纸,袋子,地址电话号清单,绳子

7.导航类:地图,指北针

8.饮食类:面包,榨菜,糖

火车票

1.08月07日21:09,北京—哈尔滨,Z1次列车,软卧,票价429.00元

2.08月08日20:15,五营—伊春,K7018次列车,硬座,票价7.00元

3.08月10日21:41,哈尔滨—北京,Z2次列车软卧,票价429.00元。

出发时间

2012年8月7日,晚8点在北京站(千万别弄错跑西站去了),公交车站集合。

旅游方案

第一套:伊春五营-嘉荫黑龙江、恐龙-伊春博物馆-哈尔滨

1.Day0-1:乘坐Z15或Z1火车,北京直达哈尔滨,21:00至第二天7:00到哈尔滨,乘坐汽车4小时到伊春12:00,之后去五营森林公园,从五营直接去嘉荫县住宿,预计晚上7点到。

2.Day2:早晨看日出游览黑龙江沿岸,去界碑合影,之后去恐龙国家地质公园。下午返回伊春市,在市内参观小兴安岭资源馆,在伊春住宿。

3.Day3-4:早上从伊春返回哈尔滨,再乘坐火车返回Z16或Z2(晚9点),第二天早7点到北京。

第二套:伊春博物馆-伊春五营-嘉荫黑龙江、恐龙-哈尔滨

1.Day0-1:乘坐Z15或Z1火车,北京到哈尔滨直达,21:00至第二天7:00到哈尔滨,乘坐汽车4小时到伊春12:00,在市内参观小兴安岭资源馆,在伊春住宿。

2.Day2:上午去五营森林公园,中午去嘉荫县住宿(2个小时)。在嘉荫县去恐龙国家地质公园,傍晚游览黑龙江沿岸,去界碑合影。去伊春的嘉荫县了解黑龙江在此段水域的生态情况,以及对伊春发展的支撑作用。

3.Day3-4:早上从嘉荫县返回哈尔滨,再乘坐火车返回Z16或Z2(晚9点),第二天早7点到北京。

最终方案

8月7日 晚上北京出发

8月8日 早7:10到哈尔滨

    中午12:00到伊春
    12:50坐上伊春到五营的车
    预计15:00前到五营
    晚上20:15火车K7018
    21:46到伊春 入住如家

8月9日 早7:10坐伊春至嘉荫长途车

    下午返回伊春(时间见机行事)
    晚上若还有时间可以市里逛逛
    入住如家

8月10日上午伊春市内观光

    中午返回哈尔滨
    晚饭哈尔滨吃 逛中央大街
    晚9:41火车

8月11日早7:30北京西

注意事项

1.在带好必备用品的基础上,尽量轻装上阵。

2.所乘坐长途车次尽量记住车牌号,以免有物品遗失时方便找回。

3.注意计算路上时间。

#旅行的实际情况

要计算好时间,因为只有不到4天的时间,还多数都在车上度过的,从伊春去嘉荫的客车每天只有一趟,上午9点开,中午到嘉荫,下午2点返回,所以时间还是比较紧的,最好是在嘉荫住宿,这样可以多玩一下,边境小城嘉荫的风景还是非常美丽的,小镇上非常干净,可以在黑龙江边乘船,远眺对岸的俄罗斯。

我们看了界碑,没有人站岗,只是一个孤零零的石碑矗立在那里。不过黑龙江上是有巡察船来回穿梭的,对岸的俄罗斯非常安静,感觉是个无人区。

杨大仙给我的报告做的最终修改版还是很给力的(写得根红苗正又红又专),顺利通过了所里的考核。


有一门奇葩的课,主要是讲述我遇到的各种各样奇葩老师或者奇葩教学内容的系列文章。是系列就意味着我遇到过不止一门课程是让我由此种想法的,并且我主观认为这些任课老师的教学方式令人堪忧。

今天要介绍的是Biostatistics and Experimental Design

meta-analysis在国内叫做荟萃分析或元分析,是个统计方法,比较新,我从没听说过,问了统计专业的同学也不清楚 。就是这样一个大家都没有接触过的分析方法,被老师用来作为讨论课的一个专题,并让大家学习做Slide介绍。

meta-analysis(我认为)是将对同个问题不同条件下的实验结果进行标准化,之后分析哪个结果准确可靠性高。追溯其最早的实际应用,是统计学家Karl Pearson所作的对某种疫苗有效性的检测。但meta-analysis这个东西是上世纪50~60年代兴起的,70年代才有了这个“官方”的名字。meta-analysis中的有些features的选择是主观进行的,所以我感觉这个分析的可靠性其实并不高。

说课程奇葩,主要是大家都没听说过的内容,给了1篇泛泛的综述,就让我们去做展示。整个Slide展示的过程中,有不少认识的缺陷,但是大家都没听说过,也就不好讨论出什么结果,老师呢,其实自己也没接触过这个方面,没有什么指导。既然这样,那做这个演讲展示的意义何在?纯做生物实验的学生统计知识有限,做数据分析纯用软件,meta-analysis中有许多需要自己选择定义的features,没有统计学专业同学的帮助,根本就无从上手。

简而言之:学以致用,然无了解者,何谓之学?何以用之?

(学以致用这个观点其实也有很多人有不同的意见,我觉得学以致用不是不追求“理”上的问题,而是突出“用”,所学必有用。这课上的累,不过还是记住了这个分析,以后闲聊,也能让听者有“虽不明,但觉厉”的感觉 :))


最近(3月份的事情了,在草稿箱里躺到现在[现在已经是12月份了-_-b])在看MIC的paper,它主要讲述的是关于最大信息相关性的定义和计算方法。它基本上是根据非参数统计的内容进行计算的,而非参数统计是在不知道样本分布的情况下进行统计量的计算。由此我想到在统计方面是不是世界上万物都有相关性,都可以计算相关性?

回答这个问题其实很简单,只要有可以统计的数据,那么就可以找到相关性(例如用回归分析的方法)。但就统计方法而言,什么是合适的统计变量,统计结果是否具在实际问题中显著性,都是因不同的数据而有所不同的。


弄清楚研究的生物问题最重要!!!

——记同stanford统计教授的谈话有感

关注大师的言行:今天算是看到了国外大师的真正面貌,由于所里安排的比较轻松,下午2点到5点每小时一个组的成员来找他交流,据导师说要是去个清华统计系,估计一天得8个小时都有小组要排队交流。看到大牛如此轻松的听导师讲自己的工作,并不时提出自己的问题,思路非常活跃,最后根据自己的经验来指点项目的不足,也谈的头头是道。

跟随大师的举动:大牛说了啥,说咱的项目研究的问题不明确,没有看到背后的生物学意义。这可是最严重的问题,很有可能之前的工作围绕的重点都是错误的,需要重新思考整个项目的想要解决的问题和方向。大牛的思考能力很强,一个新的题目,只听几分钟的报告就可以做大领悟其中的原理,找到不足。这种能力是长期锻炼的结果,需要经过时间的磨砺才能形成。

和大师一并修行:暂无任何希望。

领会大师的意境:做但尚不能成。

成为真正的大师:梦想。